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Raúl Padrón
Invertigador Titular Emérito contratado ad honorem

Laboratorio de Estructura Supramolecular

Centro de Biología Estructural (CBE) (Página oficial funciona esporadicamente) “Humberto Fernández-Morán”, IVIC

http://www.raul-padron.org/lab/      raul.padron@gmail.com         @raulpadron


Materia: Aspectos Bioquímicos, Moleculares y Celulares en Microbiología, CEA, IVIC

Clase: Estructura Secundaria y Terciaria - Predicción

CMBC 9:00 -11:00 am - Miercoles 21, Octubre, 2015
http://www.raul-padron.org/les/clases/cmbc/

Listado Examen Notas
         Favor enviar las respuestas del examen antes del día x-x-2015 al e-mail a raul.padron@gmail.com

Descargar la clase completa (pdf)

Películas usadas en la clase y útilab para la evaluación
Alfa-hélice
Hélice super-embobinada
Beta-lámina
"Kinks" de prolina
Archivos PDB
Proteinas oligoméricas
Puentes disulfuro
Dominio SH2
Miosina y contracción muscular
Cabezas bailadoras de miosina
Para ver las películas se requiere QuickTime

Descargar pdfs del Padronlab aqui: https://www.researchgate.net/profile/Raul_Padron/

Referencia para la clase:
Alberts, Johnson, Lewis, Raff. Roberts, Walter: Molecular Biology of the Cell, Sexta edición, Capítulo 3 “Proteins”, Garland Science, 2015.
Páginas 109 a  134 solamente.


Referencias para el examen:

Aspectos estructural

J. Woodhead, F. Zhao, R. Craig, E. Egelman, L. Alamo y R.Padrón, Atomic model of a myosin filament in the relaxed state. 

Nature 436: 1195-1199, 2005.

Alamo, L., Wriggers, W., Pinto, A., Bártoli, F., Salazar, L., Zhao, F., Craig, R. & Padrón, R. Three-dimensional Reconstruction of Tarantula Myosin Filaments Suggests How Phosphorylation May Regulate Myosin Activity. 

J. Mol. Biol.: 384: 780-797, 2008.
Sulbarán, G., Alamo, L., Pinto, A., Márquez, G., Méndez, F., Padrón, R. & Craig, R. An invertebrate smooth muscle with striated muscle myosin filaments
Proc. Natl. Acad. Sci. USA en prensa 2015

Secuencias, moléculas y arreglos supramoleculares
Secuencia cadena ligera reguladora de miosina de tarantula Estructura atómica del motivo de cabezas interactuantes de la miosina II de tarantula Estructura tridimensional del filamento grueso de tarantula
GenBank: EU090070.1 PDB 3DTP EMD-1950


Estructura atómica del motivo  de cabezas interactuantes de la
miosina II de tarantula ajustado al mapa del filamento grueso de Schistosoma mansoni
Estructura tridimensional
del filamento grueso de
Schistosoma mansoni
PDB 3JAX
EMD-6370



 Aspectos funcionales

Brito, R., Alamo, L., Lundberg, U., Guerrero, J. R., Pinto, A., Sulbarán, G., Gawinowicz, M. A., Craig, R. & Padrón, R. A molecular model of phosphorylation-based activation and potentiation of tarantula muscle thick filaments.

J. Mol. Biol.: 414: 44-61, 2011.
G. Sulbarán, A. Biasutto, L. Alamo, C. Riggs, A. Pinto, F. Mendez, R. Craig y R. Padrón. Different head environments in tarantula thick filaments support a cooperative activation process. 
Biophys. J.: 105: 2114-2122, 2013.
Alamo, L., Li, X., Espinoza-Fonseca, M., Pinto, A., Thomas, D., Lehman, W. & Padrón, R. Tarantula myosin free head regulatory light chain phosphorylation stiffens N-terminal extension releasing it and blocking its docking back Mol. BioSyst. 11: 2180-2189, 2015
Espinoza-Fonseca, M., Alamo, L., Pinto, A., Thomas, D. & Padrón R. Sequential Myosin Phosphorylñation Activates Tarantula Thick Filament via a Disorder-Order Transition. Mol. BioSyst.11: 2167-2179, 2015

Material de apoyo sobre contracción muscular y las cabezas interactuantes de miosina
Craig, R. y Padrón, R. “Molecular Structure of the Sarcomere. Capitulo 7. pag.129-166. Libro de texto “Myology” (Editores A. G. Engel y C. Franzini-Armstrong), Tercera edición. McGraw-Hill, Inc., Nueva York.  2004.
Padrón, R.  Filamento de miosina: Modelo atómico.
Investigación y Ciencia (versión en Español de Scientific American). 369: 28-30, Junio 2007.

Como se descubrieron las cabezas interactuantes de miosina?
Padrón, R. “Two and a half years at the LMB that imprinted my scientific career (1980-83)” Capítulo 38, pag. 315-322. Libro “Memoirs and Consequences”. Editor: Hugh Huxley (por invitación), Publicado por MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge. 2013.

18-10-2015 RP